More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1271 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  85.28 
 
 		 310 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  76.39 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  73.36 
 
 		 375 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  72.48 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  70.57 
 
 		 298 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  71.19 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  69.61 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  69.61 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  68.85 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  68.67 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  67.54 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  68.9 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  69.16 
 
 		 303 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  67.44 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  68.87 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  67.11 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  66.56 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  67.22 
 
 		 315 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  71.43 
 
 		 312 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  69.66 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  68.75 
 
 		 313 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  67.86 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  65 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  65.67 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  65.33 
 
 		 300 aa  394  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  69.03 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  66 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  66 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  66 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  62.3 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  65.78 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  58.19 
 
 		 298 aa  359  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  59.75 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  59.09 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  50.47 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  48.72 
 
 		 353 aa  292  4e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 301 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 301 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 298 aa  262  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.49 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  45.28 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 302 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  41.47 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  37.95 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  43.97 
 
 		 468 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  39.93 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.33 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  38.13 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  38.54 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 451 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.72 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  37.67 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  44.7 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.92 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 449 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  40.46 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  42.02 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  39.13 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>