More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1269 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  83.76 
 
 		 484 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  100 
 
 		 454 aa  884    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  57.05 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  61.54 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  59.64 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  60 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  59.76 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  62.22 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.64 
 
 		 426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  56.15 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  56.01 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  53.37 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  53.18 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  53.85 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  50.68 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  50.83 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  48.48 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  50.68 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  50.68 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  49.65 
 
 		 435 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  49.25 
 
 		 495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  52.88 
 
 		 537 aa  355  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  47.7 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  49.03 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  47.02 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  48.44 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  45.45 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  42.2 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  46.17 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  45.67 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.43 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  47.8 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  38.64 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.09 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.81 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  42.06 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.61 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  38.81 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  47.58 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.41 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.3 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.25 
 
 		 439 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  34.42 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.74 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  32.99 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 		 446 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  44.67 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  34.39 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  30.64 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  33.71 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.5 
 
 		 422 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.13 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  44.81 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.3 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  41.94 
 
 		 284 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  31 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  33.5 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.82 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  30.65 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  40.43 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 286 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  38.58 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  32.24 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  38.58 
 
 		 287 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.38 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.95 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  30.97 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  28.89 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  27.85 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.25 
 
 		 437 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.55 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  37.45 
 
 		 276 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.38 
 
 		 443 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.21 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  38.22 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  29.15 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.88 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.72 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.69 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 284 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.39 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.69 
 
 		 445 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.05 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.56 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.43 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 291 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  38.06 
 
 		 285 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  37.01 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  39.13 
 
 		 281 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  28.93 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  30.41 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 279 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>