182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1225 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  100 
 
 		 1058 aa  2018    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.77 
 
 		 1018 aa  280  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  37.43 
 
 		 995 aa  234  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  45.4 
 
 		 881 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  38.49 
 
 		 986 aa  223  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.75 
 
 		 989 aa  220  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  52.1 
 
 		 986 aa  209  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  46.22 
 
 		 1291 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  60.36 
 
 		 1025 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  42.32 
 
 		 1249 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  58.38 
 
 		 1023 aa  182  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  53.77 
 
 		 962 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  58.86 
 
 		 995 aa  173  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  54.73 
 
 		 1191 aa  172  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.54 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 1029 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  33.01 
 
 		 1039 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  39.03 
 
 		 1018 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  45.71 
 
 		 1020 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  41.22 
 
 		 1047 aa  164  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 		 1018 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  38.78 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  38.78 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  38.78 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  39.37 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  37.23 
 
 		 953 aa  162  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  34.23 
 
 		 1029 aa  161  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  34.23 
 
 		 1029 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  34.23 
 
 		 1029 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  30.35 
 
 		 1018 aa  161  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  55.15 
 
 		 1046 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  33.22 
 
 		 1029 aa  159  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  34.82 
 
 		 1020 aa  159  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  33.67 
 
 		 1029 aa  158  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  40.93 
 
 		 1030 aa  158  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  29.7 
 
 		 1018 aa  158  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.06 
 
 		 1017 aa  157  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  38.89 
 
 		 1029 aa  157  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.28 
 
 		 1029 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  29.78 
 
 		 1018 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  38.89 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 1018 aa  156  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  54.6 
 
 		 1009 aa  156  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  38.43 
 
 		 1029 aa  155  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  38.5 
 
 		 1029 aa  154  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  40.28 
 
 		 1013 aa  152  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  56.1 
 
 		 1006 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  41.67 
 
 		 1009 aa  151  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.78 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  48.8 
 
 		 1022 aa  147  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.67 
 
 		 1009 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.67 
 
 		 1009 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  35.76 
 
 		 1020 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.71 
 
 		 1081 aa  144  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  42.2 
 
 		 1018 aa  142  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  43.62 
 
 		 1049 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  40.1 
 
 		 1018 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  25.04 
 
 		 1038 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  33.95 
 
 		 1024 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  41.46 
 
 		 1046 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  39.89 
 
 		 1011 aa  118  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  32.02 
 
 		 1059 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  39.36 
 
 		 1033 aa  115  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  41.77 
 
 		 910 aa  114  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  40.46 
 
 		 1346 aa  110  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  43.53 
 
 		 1214 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  50.82 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  44.87 
 
 		 1101 aa  104  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  49.57 
 
 		 1211 aa  105  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  49.57 
 
 		 1211 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  50.41 
 
 		 1214 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  50.41 
 
 		 1214 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  50.41 
 
 		 1214 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  40.76 
 
 		 1238 aa  104  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  39.07 
 
 		 1088 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  32.43 
 
 		 1091 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  39.74 
 
 		 906 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  50.41 
 
 		 1214 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  49.18 
 
 		 1213 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.67 
 
 		 1219 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  36.89 
 
 		 1226 aa  102  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  38.41 
 
 		 1307 aa  101  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  30.74 
 
 		 1230 aa  101  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  38.41 
 
 		 1303 aa  101  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  53.98 
 
 		 1164 aa  101  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  32.73 
 
 		 1114 aa  100  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  46.73 
 
 		 1234 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  45.71 
 
 		 1227 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  41.1 
 
 		 815 aa  99.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.63 
 
 		 1180 aa  99.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  38.04 
 
 		 1226 aa  98.2  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  39.47 
 
 		 1223 aa  97.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  43.93 
 
 		 1223 aa  97.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  36.57 
 
 		 1085 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  33.68 
 
 		 1116 aa  96.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  46.27 
 
 		 1155 aa  96.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  30.37 
 
 		 1165 aa  96.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  46.61 
 
 		 1247 aa  96.3  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  41.4 
 
 		 1227 aa  95.5  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  37.74 
 
 		 1047 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>