More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1211 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  98.25 
 
 
343 aa  677  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
343 aa  685  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  86.55 
 
 
368 aa  592  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  82.22 
 
 
343 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  81.92 
 
 
344 aa  576  1e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  76.63 
 
 
342 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  77.33 
 
 
344 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  77.42 
 
 
343 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  73.47 
 
 
349 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  71.8 
 
 
344 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  70.85 
 
 
342 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  71.12 
 
 
350 aa  481  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  66.96 
 
 
340 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  65.78 
 
 
340 aa  468  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
346 aa  465  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.02365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  64.71 
 
 
343 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  64.71 
 
 
343 aa  459  1e-128  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 
342 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 
343 aa  451  1e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
342 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
342 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.86 
 
 
344 aa  444  1e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
343 aa  446  1e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.77131e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 
344 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 
344 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 
343 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  4.55643e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 
344 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
344 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
344 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
344 aa  439  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
344 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 
344 aa  439  1e-122  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
347 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.83454e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  58.77 
 
 
347 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.66 
 
 
344 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  61.82 
 
 
339 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.59245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  60.12 
 
 
347 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.22229e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
346 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
346 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 
346 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  58.88 
 
 
347 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.81914e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  63.61 
 
 
338 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  424  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 
343 aa  426  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 
346 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  61.63 
 
 
338 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  424  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 
343 aa  424  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  64.46 
 
 
339 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 
347 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.97933e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  65.24 
 
 
340 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  61.28 
 
 
345 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  63.3 
 
 
339 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 
340 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.87033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  59.7 
 
 
336 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 
348 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.8278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  61.52 
 
 
346 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  59.7 
 
 
339 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  57.69 
 
 
347 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.07423e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  57.69 
 
 
347 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
346 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 
354 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  57.6 
 
 
347 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.6828e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  56.08 
 
 
345 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
358 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 
346 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  58.65 
 
 
346 aa  405  1e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 
358 aa  405  1e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
342 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 
346 aa  401  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.49 
 
 
347 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  57.89 
 
 
348 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  5.73376e-09 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  55.95 
 
 
346 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 
346 aa  401  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 
347 aa  400  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.97491e-10  unclonable  2.42005e-07 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.22 
 
 
344 aa  400  1e-110  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  59.76 
 
 
335 aa  401  1e-110  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  58.21 
 
 
344 aa  400  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  5.50029e-06  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  54.63 
 
 
342 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.51 
 
 
344 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 
345 aa  397  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.62 
 
 
339 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 
343 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 
345 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 
343 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 
345 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  56.67 
 
 
344 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 
345 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 
345 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  59.05 
 
 
346 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  57.01 
 
 
359 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  2.40311e-05  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 
353 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  56.17 
 
 
343 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>