25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1199 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 545 aa  1065    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  53.91 
 
 		 880 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  42.76 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  43.94 
 
 		 427 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  44.54 
 
 		 377 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  37.91 
 
 		 650 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  36.36 
 
 		 521 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  37.97 
 
 		 701 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  36.74 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  37.13 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  32.85 
 
 		 576 aa  206  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  34.11 
 
 		 399 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  34.61 
 
 		 636 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  28.8 
 
 		 866 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  36.05 
 
 		 643 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  31.33 
 
 		 739 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32.02 
 
 		 746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  31.78 
 
 		 317 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1027 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  25.14 
 
 		 1103 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  25.14 
 
 		 1103 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4918  putative ATP-binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  34.55 
 
 		 925 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  34.55 
 
 		 893 aa  44.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>