More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1184 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 412 aa  823    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  70.3 
 
 		 411 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  54.11 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  54.66 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 753 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 768 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 738 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 800 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 748 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.46 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  40.88 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  35.8 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.93 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  32.8 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.18 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.77 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  29.87 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.6 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.68 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.12 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.54 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  36.2 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  34.39 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  35.62 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 689 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0141  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  35.36 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  31.58 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.84 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>