More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1164 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 320 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  81.97 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  42.11 
 
 		 253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 		 256 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 		 267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  42.26 
 
 		 255 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 		 273 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  41.45 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 273 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  35 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.37 
 
 		 780 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 237 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 238 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 		 378 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  32.95 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 		 232 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  30.97 
 
 		 238 aa  109  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 441 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 		 409 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  41.7 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  31.27 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  34.53 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  32.74 
 
 		 428 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.65 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.18 
 
 		 244 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3541  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.62234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  33.33 
 
 		 574 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  35.48 
 
 		 883 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 613 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  31.65 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.02 
 
 		 402 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  35.02 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.09 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  31.73 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 245 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 246 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  32.85 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.02 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 238 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  29.66 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.89 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 		 230 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 245 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.98 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.54 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 229 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 233 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.04 
 
 		 220 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 230 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.49 
 
 		 262 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>