20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1159 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  278  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  65.55 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  44.54 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  43.22 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  46.15 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  44.92 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  40.68 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1599  hypothetical protein  43.1 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7328  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7337  hypothetical protein  37.9 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0971863  hitchhiker  0.000142423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  41.18 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  31.36 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  29.66 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.226542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  30.43 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>