32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1073 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 362 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  69.17 
 
 		 380 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  63.54 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  60 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  58.61 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  47.08 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  45.14 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  45.71 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  45.71 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  42.3 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  40.86 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  43.21 
 
 		 390 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  41.48 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  40.66 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  40.38 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  40.28 
 
 		 388 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  37.61 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.87 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.08 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.69 
 
 		 831 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  30.37 
 
 		 472 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  25.26 
 
 		 504 aa  53.1  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.29 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  23.41 
 
 		 903 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.22 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.27 
 
 		 711 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  29.79 
 
 		 581 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1026 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1351 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.85 
 
 		 1140 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>