More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1056 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  100 
 
 		 561 aa  1100    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  51.68 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  33.16 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  31.7 
 
 		 403 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  30.12 
 
 		 435 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  34.92 
 
 		 421 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  30.69 
 
 		 403 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  32.08 
 
 		 383 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  31.69 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  34.06 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  34.06 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  34.06 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  34.81 
 
 		 396 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  34.81 
 
 		 396 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  33.61 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 413 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  33.59 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  30.37 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  29.56 
 
 		 434 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.38 
 
 		 376 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  31.69 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 392 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 392 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  32.58 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  34.39 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  31.65 
 
 		 392 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  31.66 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  33.16 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  31.93 
 
 		 357 aa  94.7  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  32.13 
 
 		 404 aa  88.2  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 515 aa  87  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  32.24 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  31.09 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  26.73 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  26.07 
 
 		 690 aa  73.9  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2361  acyltransferases-like protein  50.54 
 
 		 149 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.16 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  25.31 
 
 		 398 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 695 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  27.81 
 
 		 377 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  26.45 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  28.27 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  21.88 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  21.88 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  26.09 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.56 
 
 		 629 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.56 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  27.34 
 
 		 360 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  28.85 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  36.07 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  21.73 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  27.75 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  30.9 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.41 
 
 		 671 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  36.05 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.34 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.2 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.28 
 
 		 679 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  22.02 
 
 		 603 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  29.11 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  26.1 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  23.91 
 
 		 592 aa  60.8  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  25.82 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  28.94 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  26.96 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  25.65 
 
 		 637 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.12 
 
 		 675 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  35.98 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  35.06 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.1 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.18 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  22.45 
 
 		 604 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  22.45 
 
 		 604 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  26.76 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  28.25 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  25.65 
 
 		 683 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  27.94 
 
 		 759 aa  57.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  26.97 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  28 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  28.04 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  25.24 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  28.49 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  25.99 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 356 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.35 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  28.74 
 
 		 377 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.38 
 
 		 657 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.13 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.91 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>