15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1030 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  76.7 
 
 		 476 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1149    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  85.71 
 
 		 572 aa  910    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  83.27 
 
 		 569 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  92.17 
 
 		 573 aa  979    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  91.48 
 
 		 572 aa  988    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  58.82 
 
 		 543 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  57.63 
 
 		 552 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  52.14 
 
 		 568 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  52.03 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  51.7 
 
 		 550 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  52.45 
 
 		 527 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  50.57 
 
 		 555 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  65.96 
 
 		 56 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  26.49 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>