More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1028 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.59 
 
 
523 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  81.07 
 
 
523 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  93.06 
 
 
519 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  94.61 
 
 
517 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
519 aa  1012    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.78 
 
 
409 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.8 
 
 
499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  45.47 
 
 
484 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.01 
 
 
560 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  44.72 
 
 
481 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  44.11 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.72 
 
 
530 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  41.48 
 
 
480 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.48 
 
 
480 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.15 
 
 
481 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.15 
 
 
481 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.15 
 
 
481 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.67 
 
 
474 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.87 
 
 
455 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  42.79 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.75 
 
 
491 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  54.62 
 
 
460 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.4 
 
 
456 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  40.06 
 
 
433 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  35.27 
 
 
450 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.87 
 
 
460 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.25 
 
 
558 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  31.27 
 
 
460 aa  93.6  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  29.61 
 
 
446 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33.86 
 
 
526 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  29.52 
 
 
450 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  26.52 
 
 
788 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.52 
 
 
788 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.46 
 
 
758 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.4 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.34 
 
 
716 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3838  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.74 
 
 
636 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0797  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.41 
 
 
669 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.15 
 
 
1249 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1381  cell division protein  25.42 
 
 
804 aa  64.3  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.14 
 
 
763 aa  64.3  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  25.38 
 
 
797 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  23.28 
 
 
953 aa  62.4  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3828  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000134118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3645  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00104928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3535  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000424384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3553  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3930  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000252394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3842  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000180384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3893  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0045654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3806  stage III sporulation protein E  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98433e-27 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.14 
 
 
776 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1406  DNA translocase FtsK  28.57 
 
 
793 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000239952  hitchhiker  0.000000381698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  28.57 
 
 
608 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.48 
 
 
1604 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2445  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.4 
 
 
793 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000220657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  29.23 
 
 
777 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3564  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.34 
 
 
794 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000378493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0620  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
1056 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000070904  normal  0.339115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.64 
 
 
1035 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0756  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.91 
 
 
803 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0143018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1654  ATPase  25 
 
 
533 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.815556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0632  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.01 
 
 
1679 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1944  cell division FtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
726 aa  60.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.44 
 
 
776 aa  60.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  26.1 
 
 
607 aa  60.5  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1448  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.56 
 
 
741 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.464965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  29.64 
 
 
1284 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4440  cell division protein  29.64 
 
 
1266 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0435  ftsk/spoiiie family protein  29.64 
 
 
1356 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.099087  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.3 
 
 
787 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  33.13 
 
 
1807 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.51 
 
 
801 aa  59.7  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  33.13 
 
 
1807 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4823  ftsk/spoiiie family protein  29.64 
 
 
1270 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.04 
 
 
1393 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.18 
 
 
776 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  29.64 
 
 
1266 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  29.64 
 
 
1311 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  29.64 
 
 
1338 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  26.79 
 
 
768 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.27 
 
 
2947 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  29.64 
 
 
1311 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0320  DNA translocase ftsK  25.2 
 
 
666 aa  58.9  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.437636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4801  ftsk/spoiiie family protein  29.64 
 
 
1359 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0440152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  29.18 
 
 
776 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0173  FtsK/SpoIIIE family protein  24.62 
 
 
846 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.857574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2341  cell division ftsk transmembrane protein  26.74 
 
 
781 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.86356  normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0601  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.08 
 
 
838 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0575901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  25.96 
 
 
770 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1161  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.64 
 
 
770 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.8 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  25 
 
 
816 aa  57.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0692  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.33 
 
 
784 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  27.63 
 
 
776 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1831  cell division protein FtsK/SpoIIIE  28.15 
 
 
1274 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.953109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1796  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.15 
 
 
1274 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.988037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
809 aa  57.4  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.32 
 
 
799 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  27.3 
 
 
775 aa  57  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>