More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0995 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 452 aa  839    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  65.76 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  59.95 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  58 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  56.92 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  52.66 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  43.22 
 
 		 750 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  35.66 
 
 		 748 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 756 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 749 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  35.35 
 
 		 715 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  33.5 
 
 		 764 aa  199  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 715 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 715 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  33.25 
 
 		 767 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  33.48 
 
 		 723 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 747 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 		 703 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  32.08 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  30.98 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 775 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  35.08 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  29.81 
 
 		 816 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.9 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.1 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 		 410 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  35.8 
 
 		 410 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  27.68 
 
 		 951 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  34.62 
 
 		 683 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.41 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.19 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  30.1 
 
 		 883 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.19 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.23 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  27.75 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28 
 
 		 387 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.01 
 
 		 399 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  27.75 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  27.75 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.75 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.75 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.75 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  26.91 
 
 		 806 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.75 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.75 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.83 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.81 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.44 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.44 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.44 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.25 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.94 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.73 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.73 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.27 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.67 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 469 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>