More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0991 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  45.59 
 
 		 1827 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  47.86 
 
 		 2111 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  100 
 
 		 1076 aa  2173    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  45.84 
 
 		 2101 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  46.51 
 
 		 2085 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  44.06 
 
 		 2126 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  42.68 
 
 		 1806 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  47.35 
 
 		 2108 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  46.51 
 
 		 2085 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  42.49 
 
 		 1805 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  43.54 
 
 		 1537 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  48.78 
 
 		 2220 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  46.4 
 
 		 2085 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  44.52 
 
 		 1190 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  44.52 
 
 		 1190 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  42.34 
 
 		 1876 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 		 1190 aa  619  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 		 1520 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  42.84 
 
 		 1520 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  42.27 
 
 		 1812 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 		 1828 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  42.29 
 
 		 2188 aa  591  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  42.45 
 
 		 1823 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1704 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1704 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1704 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  41.94 
 
 		 1822 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 2230 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 2232 aa  582  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 1656 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.28 
 
 		 1580 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  39.81 
 
 		 2162 aa  582  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.28 
 
 		 1580 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  42.67 
 
 		 2111 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  41.21 
 
 		 1577 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  42.16 
 
 		 1819 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  39.06 
 
 		 1581 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  40.3 
 
 		 1744 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  40.14 
 
 		 2225 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.92 
 
 		 1087 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  41.74 
 
 		 1263 aa  572  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 		 1580 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.32 
 
 		 2890 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 		 1698 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.16 
 
 		 2136 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 		 1835 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.38 
 
 		 1144 aa  549  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  37.08 
 
 		 1966 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.66 
 
 		 3424 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  34.58 
 
 		 1587 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.65 
 
 		 3176 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.95 
 
 		 4478 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.14 
 
 		 1939 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.25 
 
 		 3111 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.5 
 
 		 1354 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.76 
 
 		 1804 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  38.85 
 
 		 3427 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 2551 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.51 
 
 		 1559 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  40.41 
 
 		 1832 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  38.57 
 
 		 3930 aa  529  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.54 
 
 		 1559 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.41 
 
 		 2880 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.52 
 
 		 1867 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.56 
 
 		 1349 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.7 
 
 		 1349 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.37 
 
 		 2333 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  37.88 
 
 		 3449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  36.11 
 
 		 3337 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.95 
 
 		 2020 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  37.14 
 
 		 1114 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.32 
 
 		 1832 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  38.48 
 
 		 4607 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 		 3645 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 1874 aa  506  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.3 
 
 		 1822 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.05 
 
 		 1305 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.39 
 
 		 2966 aa  502  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.4 
 
 		 2277 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.31 
 
 		 2719 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  38.09 
 
 		 7279 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  34.58 
 
 		 1704 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.41 
 
 		 1372 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  38.92 
 
 		 3508 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.01 
 
 		 4183 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  35.94 
 
 		 3101 aa  492  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  33.83 
 
 		 1402 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  35.5 
 
 		 2108 aa  489  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.87 
 
 		 4151 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  37.59 
 
 		 2719 aa  486  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.3 
 
 		 3130 aa  485  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 3693 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.51 
 
 		 1337 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 3693 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.28 
 
 		 3676 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  37.47 
 
 		 3702 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 7110 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  36.41 
 
 		 2126 aa  482  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 		 4111 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.73 
 
 		 950 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>