More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0943 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 545 aa  1048    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.41 
 
 		 572 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  61.33 
 
 		 528 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  58.1 
 
 		 532 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.93 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  54.36 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.32 
 
 		 518 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  55.51 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  55.32 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  57.71 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  55.94 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  56.38 
 
 		 520 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.92 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.78 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  51.02 
 
 		 550 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.15 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  38.64 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.63 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  39.31 
 
 		 552 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.56 
 
 		 583 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.42 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 		 554 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.17 
 
 		 563 aa  323  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  39.41 
 
 		 531 aa  323  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  39.22 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.7 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.58 
 
 		 557 aa  312  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.25 
 
 		 584 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.8 
 
 		 534 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  37.06 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  34.62 
 
 		 559 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.31 
 
 		 546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.38 
 
 		 535 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  37.57 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 		 536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.53 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  37.84 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 		 579 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.57 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.36 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  37.18 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.97 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 534 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.68 
 
 		 510 aa  216  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  31.57 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.34 
 
 		 467 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.66 
 
 		 554 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  31.88 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 520 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 		 516 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  31.81 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 		 523 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.38 
 
 		 484 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 484 aa  157  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 		 484 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.38 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.38 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.38 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.02 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.52 
 
 		 451 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.94 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.94 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.32 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.27 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  37.09 
 
 		 572 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.9 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.09 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  25.65 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.85 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.41 
 
 		 470 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.13 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.27 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.84 
 
 		 470 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.26 
 
 		 470 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.1 
 
 		 464 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.64 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.84 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.64 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.15 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.38 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.11 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.11 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.11 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.18 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.35 
 
 		 466 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.43 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>