20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0905 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0905  SpdA protein  100 
 
 		 227 aa  440  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2672  hypothetical protein  39.41 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2777  hypothetical protein  43.56 
 
 		 294 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2731  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8994  hypothetical protein  38.79 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0129  hypothetical protein  35.62 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4019  hypothetical protein  39.23 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1851  hypothetical protein  40.55 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.211704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2663  hypothetical protein  38.76 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7145  hypothetical protein  51.75 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4424  hypothetical protein  38.07 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3034  hypothetical protein  38.2 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3444  hypothetical protein  52.33 
 
 		 280 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3575  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3031  hypothetical protein  43.09 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.530145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2054  hypothetical protein  57.35 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.081769  normal  0.289523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0083  hypothetical protein  33.76 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0841499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8665  hypothetical protein  27.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4532  putative FHA domain containing protein  56.25 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3033  hypothetical protein  47.92 
 
 		 89 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>