269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0876 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 934 aa  1844    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  42.42 
 
 		 900 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  42.21 
 
 		 897 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  41.78 
 
 		 859 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  41.09 
 
 		 992 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  47.07 
 
 		 675 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 		 911 aa  435  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  41.22 
 
 		 713 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  38.48 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  36.12 
 
 		 1056 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 785 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.54 
 
 		 1000 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.31 
 
 		 963 aa  343  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  35.11 
 
 		 899 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1068 aa  328  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  33.15 
 
 		 1324 aa  320  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  33.09 
 
 		 1500 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  32.57 
 
 		 845 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  33.46 
 
 		 849 aa  290  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  46.03 
 
 		 385 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.51 
 
 		 1309 aa  287  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.06 
 
 		 843 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  32.76 
 
 		 838 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  32.49 
 
 		 1314 aa  278  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1383 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 		 1424 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1039 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1523 aa  230  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  30.37 
 
 		 1509 aa  228  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.25 
 
 		 1311 aa  211  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  43.54 
 
 		 373 aa  209  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1088 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  64.41 
 
 		 405 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1283 aa  196  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.57 
 
 		 801 aa  195  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.66 
 
 		 793 aa  190  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 1128 aa  189  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 1125 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  28.18 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1105 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  32.26 
 
 		 847 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 1262 aa  180  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  63.92 
 
 		 161 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 		 1185 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  59.32 
 
 		 564 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 		 1050 aa  169  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 1288 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  41.92 
 
 		 715 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 850 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 776 aa  164  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 953 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  52.12 
 
 		 358 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  42.91 
 
 		 1355 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  29.9 
 
 		 686 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 924 aa  155  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 814 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 857 aa  154  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1010 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  55.97 
 
 		 540 aa  149  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 		 1146 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 966 aa  145  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  49.68 
 
 		 266 aa  145  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.06 
 
 		 1131 aa  141  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.7 
 
 		 1326 aa  138  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.17 
 
 		 1261 aa  137  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  45.51 
 
 		 705 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  41.94 
 
 		 235 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 837 aa  132  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  44.58 
 
 		 237 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  44.91 
 
 		 238 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  47.65 
 
 		 1901 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  43.51 
 
 		 388 aa  125  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  45.03 
 
 		 374 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  42.86 
 
 		 157 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 454 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 1136 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  33.01 
 
 		 457 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  20.74 
 
 		 822 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.61 
 
 		 1488 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 284 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 751 aa  104  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 767 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.54 
 
 		 1468 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 991 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  36.97 
 
 		 268 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 652 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.85 
 
 		 1328 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 568 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 568 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1215 aa  97.8  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  33.03 
 
 		 392 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1212 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 304 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 949 aa  90.1  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.9 
 
 		 702 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.8 
 
 		 672 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  37.14 
 
 		 524 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 671 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>