More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0801 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  89.17 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  75.16 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  73.72 
 
 		 159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  73.86 
 
 		 154 aa  237  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  70.06 
 
 		 162 aa  234  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  67.09 
 
 		 160 aa  233  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  76.35 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  67.52 
 
 		 161 aa  230  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  67.31 
 
 		 159 aa  227  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 159 aa  227  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  71.33 
 
 		 160 aa  227  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  72 
 
 		 155 aa  226  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  69.62 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  64.74 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  66.45 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  68.63 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  68.09 
 
 		 161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  61.69 
 
 		 165 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  62.82 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  62.34 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  62.34 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  62.34 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  61.04 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  60.26 
 
 		 160 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  63.7 
 
 		 167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  66.89 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  62.91 
 
 		 177 aa  194  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  65.99 
 
 		 177 aa  194  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  62.34 
 
 		 176 aa  193  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  62.25 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  58.06 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  61.49 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54.84 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  55.13 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  55.13 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.32 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 152 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  57.24 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  56.67 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 155 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07630  SsrA-binding protein  61.07 
 
 		 171 aa  167  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50.99 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  54.97 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  55 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.6 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  53.02 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  48 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  54.14 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 155 aa  154  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>