173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0800 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  100 
 
 		 510 aa  1019    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  42.24 
 
 		 567 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  42 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  44.06 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  44.33 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  44.33 
 
 		 310 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  32.47 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.89 
 
 		 556 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.15 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.2 
 
 		 620 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  30.81 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  32.07 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.87 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.41 
 
 		 568 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.9 
 
 		 580 aa  120  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  29.86 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  28.46 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.08 
 
 		 551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 567 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.15 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  29.57 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  29.57 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.33 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  34.41 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  35.86 
 
 		 748 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  44.3 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  32.33 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  32.98 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  32.98 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  32.75 
 
 		 475 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  31.45 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.22 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.22 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  31.48 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.32 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  31.35 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30.95 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 605 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  29.88 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  29.88 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  29.88 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  29.28 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 628 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  30.36 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  29.83 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.9 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  31.11 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 584 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  40 
 
 		 553 aa  97.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  36.11 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  28.18 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  37.67 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  31.33 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  27.42 
 
 		 603 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  29.41 
 
 		 545 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 360 aa  91.3  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.52 
 
 		 714 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 602 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  30.32 
 
 		 404 aa  90.1  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  35 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  27.59 
 
 		 561 aa  87.8  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  26.58 
 
 		 547 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  31.08 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 488 aa  87  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  37.84 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  27.45 
 
 		 481 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  32.46 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  29.19 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.66 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  26.58 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.34 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  29.77 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  29.1 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.04 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.5 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  31.34 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  28.77 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.65 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 743 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2026  hypothetical protein  26.43 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  28.05 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 620 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  37.17 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  29.2 
 
 		 340 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  25.93 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  35.59 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  34.59 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  37.17 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  32.34 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  32.24 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  35.9 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  35.04 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  35.9 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  35.04 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  30.67 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>