19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0769 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  818    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  44.93 
 
 
411 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  61.4 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  51.43 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  48.19 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  49.12 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  35.61 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  49.28 
 
 
248 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  51.52 
 
 
229 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  50.88 
 
 
250 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  48.57 
 
 
311 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  44.66 
 
 
242 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  30.43 
 
 
295 aa  56.6  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  51.72 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  26.39 
 
 
2179 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
1051 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  45.61 
 
 
212 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  35.42 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>