More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0754 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
880 aa  1762    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  71.05 
 
 
819 aa  990    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  47.24 
 
 
871 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  44.54 
 
 
877 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  43.55 
 
 
773 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  44.1 
 
 
801 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  43.43 
 
 
789 aa  475  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  40.09 
 
 
892 aa  459  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 
807 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  40.15 
 
 
744 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.88 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  39.91 
 
 
739 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.92 
 
 
737 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
820 aa  439  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  40.86 
 
 
1057 aa  439  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  38.76 
 
 
740 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.3 
 
 
747 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.48 
 
 
736 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.98 
 
 
766 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
758 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  35.76 
 
 
784 aa  382  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  36.47 
 
 
771 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  36.06 
 
 
727 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
758 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  36.36 
 
 
833 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.29 
 
 
821 aa  366  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  37.09 
 
 
821 aa  363  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
705 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  37.42 
 
 
721 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  37.1 
 
 
726 aa  354  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  36.74 
 
 
814 aa  353  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.58 
 
 
763 aa  351  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  38.01 
 
 
761 aa  343  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
801 aa  340  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.47 
 
 
695 aa  339  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 
807 aa  339  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.89 
 
 
765 aa  335  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  38.27 
 
 
680 aa  335  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
808 aa  335  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 
710 aa  335  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
710 aa  332  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  33.38 
 
 
772 aa  330  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
723 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  35 
 
 
840 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  32.69 
 
 
830 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  37.62 
 
 
722 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
766 aa  324  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 
816 aa  320  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
816 aa  320  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
816 aa  320  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
816 aa  313  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
818 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.7 
 
 
905 aa  311  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
828 aa  311  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 
817 aa  311  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
1245 aa  309  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.92 
 
 
817 aa  307  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
695 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.57 
 
 
720 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
830 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
831 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
831 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  33.05 
 
 
810 aa  303  9e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  35.66 
 
 
838 aa  303  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
703 aa  302  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
824 aa  299  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.38 
 
 
761 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
648 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  34.19 
 
 
693 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.36 
 
 
806 aa  290  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
700 aa  289  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.83 
 
 
727 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 
811 aa  287  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  32.3 
 
 
773 aa  286  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 
714 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  35.02 
 
 
726 aa  283  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.31 
 
 
649 aa  282  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.16 
 
 
723 aa  282  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 
643 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 
643 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 
714 aa  281  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.17 
 
 
727 aa  280  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 
761 aa  280  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.9 
 
 
643 aa  278  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.47 
 
 
765 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.19 
 
 
727 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.24 
 
 
734 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.93 
 
 
728 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.57 
 
 
709 aa  271  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.08 
 
 
712 aa  270  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
1065 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.96 
 
 
683 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.02 
 
 
770 aa  267  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.5 
 
 
732 aa  267  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  32.6 
 
 
768 aa  267  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 
704 aa  266  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.48 
 
 
751 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.92 
 
 
776 aa  265  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  31.27 
 
 
755 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.64 
 
 
661 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>