More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0732 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  84.75 
 
 
237 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  62.61 
 
 
235 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  64.35 
 
 
233 aa  271  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.92 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.88 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  41.59 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.75 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.75 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  33.12 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.32 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.67 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  38 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.84 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.57 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
252 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  37.86 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.77 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
1106 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.51 
 
 
258 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.14 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  42.2 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.21 
 
 
230 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.88 
 
 
260 aa  61.6  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  28.05 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.63 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  32.48 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.83 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.71 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.58 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  27.44 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.83 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.99 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  30.07 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  27.44 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.17 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.67 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.12 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.17 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.81 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
250 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  27.44 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.17 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.66 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.58 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.43 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.09 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
248 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.78 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.72 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.72 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.43 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
202 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
293 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.78 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.88 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.63 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.4 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>