More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0727 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
833 aa  1636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  70.89 
 
 
865 aa  592  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.26 
 
 
828 aa  587  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  57.51 
 
 
641 aa  346  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  59.27 
 
 
734 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  60.67 
 
 
721 aa  334  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60 
 
 
898 aa  313  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.63 
 
 
932 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  56.23 
 
 
835 aa  291  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  57.09 
 
 
644 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.8 
 
 
585 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.95 
 
 
737 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  57.68 
 
 
611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  48.55 
 
 
573 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  59.86 
 
 
723 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  55.51 
 
 
624 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  52.41 
 
 
612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
771 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
624 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  54.87 
 
 
613 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.55 
 
 
599 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  51.28 
 
 
589 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  58.3 
 
 
520 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.53 
 
 
716 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
528 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  57.03 
 
 
676 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.45 
 
 
520 aa  244  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  49.32 
 
 
652 aa  244  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 
421 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.6 
 
 
729 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
535 aa  237  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  51.26 
 
 
560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
555 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
616 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 
569 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
481 aa  232  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.02 
 
 
618 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 
455 aa  231  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
569 aa  230  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.74 
 
 
814 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  42.18 
 
 
1553 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.08 
 
 
557 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.14 
 
 
751 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  48.16 
 
 
587 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  45.79 
 
 
547 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.15 
 
 
642 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.55 
 
 
600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 
292 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
820 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  39.19 
 
 
1344 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 
586 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.36 
 
 
806 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  41.95 
 
 
1357 aa  220  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.18 
 
 
1481 aa  220  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  44.55 
 
 
590 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  45.06 
 
 
405 aa  220  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  46 
 
 
608 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.66 
 
 
1262 aa  219  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  48.9 
 
 
716 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
360 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
696 aa  217  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
571 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.82 
 
 
673 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.24 
 
 
490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  47.31 
 
 
620 aa  214  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.21 
 
 
496 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  51.5 
 
 
551 aa  213  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  41.89 
 
 
1510 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 
644 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
694 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
680 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  47.97 
 
 
630 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
542 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.26 
 
 
761 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  37.74 
 
 
1163 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  44.9 
 
 
564 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  46.02 
 
 
637 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
637 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.87 
 
 
1599 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.31 
 
 
1256 aa  209  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
604 aa  208  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  46.69 
 
 
646 aa  208  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
544 aa  208  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
695 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.95 
 
 
664 aa  207  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.82 
 
 
919 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.56 
 
 
1652 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  47.06 
 
 
522 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40 
 
 
673 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.2 
 
 
1789 aa  204  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  39.2 
 
 
1367 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.69 
 
 
687 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  49.18 
 
 
597 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.65 
 
 
1363 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 
638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.53 
 
 
947 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  45 
 
 
481 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 
550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
837 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>