More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0720 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 408 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  66.75 
 
 		 382 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  47.16 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  43 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  49.38 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  38.63 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 385 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  34.36 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  34.2 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  31.48 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  23.82 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  40.87 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 371 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.17 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.54 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  34.18 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.55 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.9 
 
 		 430 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.86 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  22.03 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.45 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  24.12 
 
 		 351 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  35.22 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  21.04 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 524 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 361 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 360 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>