More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0683 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
695 aa  1357    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  76.51 
 
 
1029 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  62.21 
 
 
673 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  56.11 
 
 
674 aa  272  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  55.73 
 
 
617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  48.38 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  49.1 
 
 
659 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
411 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  52.46 
 
 
468 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  55.16 
 
 
528 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  48.86 
 
 
525 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  48.7 
 
 
776 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
562 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.21 
 
 
419 aa  226  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
571 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.13 
 
 
678 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.21 
 
 
596 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  46.91 
 
 
418 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  41.16 
 
 
501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.37 
 
 
521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  43.68 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 
766 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  46.07 
 
 
559 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
487 aa  211  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  43.69 
 
 
422 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  48.4 
 
 
461 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  53.57 
 
 
531 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 
535 aa  209  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  45.66 
 
 
705 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 
460 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  47.84 
 
 
493 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
703 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 
575 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  48.97 
 
 
377 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
855 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.52 
 
 
532 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.71 
 
 
668 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
419 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.43 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
470 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
493 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
631 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
674 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  42.69 
 
 
575 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
553 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
525 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
534 aa  193  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 
595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  47.51 
 
 
621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 
583 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
391 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  44.63 
 
 
638 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.39 
 
 
659 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
466 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 
721 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
468 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
507 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  39.34 
 
 
692 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
556 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.59 
 
 
650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.42 
 
 
405 aa  181  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.49 
 
 
579 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 
345 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  40.78 
 
 
661 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  46.6 
 
 
650 aa  178  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
612 aa  176  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  43.05 
 
 
604 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  43.04 
 
 
593 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.81 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.01 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  33.92 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
776 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
503 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  44.04 
 
 
532 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.77 
 
 
591 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.5 
 
 
681 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
476 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
660 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  37.97 
 
 
638 aa  172  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.96 
 
 
512 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  44.74 
 
 
581 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  40.37 
 
 
623 aa  171  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  41.7 
 
 
668 aa  171  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.08 
 
 
627 aa  170  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.68 
 
 
613 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  43.61 
 
 
482 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.82 
 
 
598 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  41.26 
 
 
618 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.22 
 
 
603 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  40.56 
 
 
673 aa  168  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
615 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.13 
 
 
693 aa  167  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.84 
 
 
632 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.41 
 
 
668 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>