More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0632 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 101 aa  197  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  97.03 
 
 		 101 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  87.25 
 
 		 102 aa  173  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  86.27 
 
 		 102 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  85.29 
 
 		 104 aa  170  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  82.35 
 
 		 102 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  81.37 
 
 		 102 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  79.61 
 
 		 103 aa  166  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  85.26 
 
 		 98 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  85.44 
 
 		 103 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  84.31 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  78.64 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  85.42 
 
 		 98 aa  159  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  82.11 
 
 		 97 aa  157  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  81.05 
 
 		 97 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  81.91 
 
 		 97 aa  153  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  80 
 
 		 97 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  80 
 
 		 97 aa  151  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 		 98 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  80.21 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  76.29 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  76.29 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  75.51 
 
 		 100 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  73.2 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  73.2 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  73.2 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  76.04 
 
 		 99 aa  147  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  79.79 
 
 		 98 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  78.72 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  78.12 
 
 		 98 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  75 
 
 		 99 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  78.72 
 
 		 97 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  72.63 
 
 		 98 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  75.53 
 
 		 97 aa  141  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  72.63 
 
 		 98 aa  136  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  67.02 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  67.71 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  61.46 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  56 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 94 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  55.67 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  61.11 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>