289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0629 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  63.81 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.8 
 
 
223 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 
201 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
222 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
207 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.48 
 
 
218 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 
199 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
204 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.99 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.24 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.3 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.31 
 
 
199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  38.55 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 
197 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.3 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.43 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  38.94 
 
 
221 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.24 
 
 
215 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 
207 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.08 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.72 
 
 
202 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
203 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
198 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.01 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.22 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.68 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.22 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.14 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.7 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.22 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.3 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
203 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
216 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.08 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.96 
 
 
208 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
207 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
198 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
198 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.77 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  36.36 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  38.07 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
215 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
204 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.78 
 
 
204 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.39 
 
 
201 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.67 
 
 
216 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.39 
 
 
201 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  35.43 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.85 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.12 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.71 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  37.36 
 
 
203 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  36.57 
 
 
202 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  37.36 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.02 
 
 
198 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.64 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  35.87 
 
 
201 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.05 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.05 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.58 
 
 
203 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.91 
 
 
209 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  35.2 
 
 
201 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.05 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.05 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.05 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.05 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  36.78 
 
 
203 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.71 
 
 
202 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
201 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  34.86 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 
212 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.05 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.63 
 
 
210 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  36.67 
 
 
201 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
205 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  35.75 
 
 
201 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.43 
 
 
204 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  35.75 
 
 
201 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  36.78 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.21 
 
 
193 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  35.75 
 
 
201 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.96 
 
 
232 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.6 
 
 
204 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.25 
 
 
206 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>