More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0604 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  84.53 
 
 		 279 aa  480  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  63.16 
 
 		 272 aa  324  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  60.15 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  64.23 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  60.38 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  65.33 
 
 		 281 aa  311  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  63.4 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  59.47 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  57.89 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  59.85 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  59.54 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  57.74 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 		 258 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  55.64 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  52.06 
 
 		 275 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  51.88 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  55.17 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  52.21 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  55.17 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  51.43 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  55.17 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  51.64 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  52.79 
 
 		 270 aa  245  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 250 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  50.53 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  53.46 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  50.21 
 
 		 236 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  45.1 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  45.78 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  50.4 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  45.88 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  47.15 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  47.15 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.84 
 
 		 269 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  46.67 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 		 248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 		 248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  48.02 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  42.57 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  46.07 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2949  methionine aminopeptidase, type I  50.75 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  45.12 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3121  methionine aminopeptidase, type I  49.08 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  48.61 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  52.16 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  44.49 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29520  methionine aminopeptidase, type I  50.18 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.938726  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  48.32 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  48.32 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  48.32 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  47.39 
 
 		 249 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  45.56 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  45.45 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  45.56 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  44.27 
 
 		 276 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  55.61 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  45.88 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  43.53 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  45.49 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  40.31 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  44.76 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  39.92 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  45.31 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  39.92 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>