More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0603 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  92.63 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  72.81 
 
 		 217 aa  334  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  72.09 
 
 		 217 aa  321  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  72.09 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  70.83 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  71.16 
 
 		 217 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  71.3 
 
 		 217 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  71.76 
 
 		 217 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  63.89 
 
 		 219 aa  283  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  62.73 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  56.13 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  55.4 
 
 		 214 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  55.4 
 
 		 214 aa  250  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  53.77 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  54.67 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  52.58 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  53.27 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  51.85 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  51.89 
 
 		 217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  55.66 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  52.56 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  50.7 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  55.39 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  57.94 
 
 		 189 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  49.53 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  53.77 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  50.94 
 
 		 214 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  54.15 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  49.07 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  52.66 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  49.07 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  52.45 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  57.87 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  52.45 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  51.96 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  50.23 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  51.47 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  51.96 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  51.47 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  51.47 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  49.3 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  53.92 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  52.94 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  54.04 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  51.42 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  52.09 
 
 		 216 aa  228  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  52.58 
 
 		 214 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50.98 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50.98 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50.98 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50.98 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50.98 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  52.83 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  48.31 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  53.43 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  50.49 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  50.49 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.76 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.3 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  52.29 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  52.94 
 
 		 423 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  50.91 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  49.77 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  50.91 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  50.51 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.69 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  50.46 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  50.91 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  48.15 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  50.22 
 
 		 221 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  50.46 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  50.45 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  51.46 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  50 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  50.45 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  49.52 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  49.55 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  47.96 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  50 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  49.09 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  46.23 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  48.89 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  47.3 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.49 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  48.22 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  49.33 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.37 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  49.11 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.71 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50.23 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  49.55 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  49.55 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  54.3 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  49.51 
 
 		 208 aa  208  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  48.66 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  48.66 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  48.66 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>