More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0559 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
178 aa  346  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  80.46 
 
 
175 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
180 aa  191  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 
176 aa  190  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
180 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
180 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
188 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 
179 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  50.6 
 
 
178 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  61.93 
 
 
185 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
178 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
191 aa  111  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
215 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
166 aa  103  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
182 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
191 aa  97.8  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 
186 aa  92  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  37.18 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
208 aa  87.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
188 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  37.09 
 
 
474 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
192 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
213 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.01 
 
 
477 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  36.78 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  40.4 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  31.35 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  26.92 
 
 
479 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  26.92 
 
 
479 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  33.59 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.85 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1741  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0662938  normal  0.536983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>