More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0539 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  87.83 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  87.97 
 
 		 226 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  86.45 
 
 		 216 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  86.71 
 
 		 199 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  86.45 
 
 		 182 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  88.67 
 
 		 184 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  83.23 
 
 		 226 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  83.23 
 
 		 226 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  82.58 
 
 		 184 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  79.11 
 
 		 182 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  72.47 
 
 		 184 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  81.94 
 
 		 184 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  81.94 
 
 		 184 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  81.94 
 
 		 184 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  80 
 
 		 184 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  80 
 
 		 184 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.7 
 
 		 181 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  79.35 
 
 		 184 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  74.1 
 
 		 183 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  73.94 
 
 		 185 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.13 
 
 		 184 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  79.35 
 
 		 183 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  78.71 
 
 		 183 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.15 
 
 		 183 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  78.67 
 
 		 183 aa  261  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  76.77 
 
 		 184 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  75.48 
 
 		 183 aa  254  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.62 
 
 		 180 aa  251  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.86 
 
 		 183 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  68.42 
 
 		 178 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  64.6 
 
 		 174 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  60.99 
 
 		 179 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  69.59 
 
 		 179 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  65.43 
 
 		 167 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.92 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  68.21 
 
 		 167 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  68.53 
 
 		 213 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.67 
 
 		 200 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.67 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.99 
 
 		 200 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.35 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 		 169 aa  211  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 170 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 		 170 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 		 170 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  59.6 
 
 		 170 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  55.83 
 
 		 168 aa  208  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.62 
 
 		 170 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.29 
 
 		 169 aa  205  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  59.73 
 
 		 167 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.14 
 
 		 183 aa  204  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  55.49 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  55.49 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.38 
 
 		 794 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  56.38 
 
 		 794 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  60.27 
 
 		 169 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 173 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 160 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 160 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.93 
 
 		 158 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 159 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.93 
 
 		 159 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.9 
 
 		 170 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 158 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 158 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 		 169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  54.44 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 158 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 179 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 179 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 179 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 170 aa  196  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 166 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 158 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 159 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 		 171 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  60.26 
 
 		 158 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  58.39 
 
 		 159 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 172 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 		 158 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  59.29 
 
 		 170 aa  195  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  59.59 
 
 		 172 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 159 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 220 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  55.77 
 
 		 172 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>