More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0531 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
612 aa  1198    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  62.24 
 
 
624 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  57.62 
 
 
613 aa  318  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  61.57 
 
 
616 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  60.22 
 
 
520 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 
721 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  51.6 
 
 
589 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  53.02 
 
 
624 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  50.34 
 
 
734 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
652 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  54.31 
 
 
560 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  51.71 
 
 
608 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.24 
 
 
644 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  52.82 
 
 
833 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.81 
 
 
585 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 
421 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.79 
 
 
865 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
638 aa  246  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  48.4 
 
 
594 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.43 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  51.53 
 
 
676 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  49.01 
 
 
680 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
541 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  46.9 
 
 
555 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.46 
 
 
520 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
604 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  47.46 
 
 
514 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  50.2 
 
 
569 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50.55 
 
 
641 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 
573 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
528 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
455 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  47.12 
 
 
560 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.99 
 
 
932 aa  237  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.19 
 
 
557 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.87 
 
 
814 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
608 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  49.83 
 
 
694 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.76 
 
 
587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 
535 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  47.33 
 
 
548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.11 
 
 
729 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.21 
 
 
898 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  48.67 
 
 
637 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  49.28 
 
 
646 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  52 
 
 
1148 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  53.36 
 
 
551 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50 
 
 
835 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  47.33 
 
 
547 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
771 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.42 
 
 
828 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  50.39 
 
 
564 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  47.84 
 
 
716 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  49.44 
 
 
611 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.28 
 
 
806 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  50.96 
 
 
587 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.62 
 
 
599 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  48.82 
 
 
637 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  50.36 
 
 
589 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.69 
 
 
723 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.84 
 
 
751 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 
620 aa  220  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
569 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
644 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
542 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
544 aa  216  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.83 
 
 
600 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  43.89 
 
 
292 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
820 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  48.08 
 
 
742 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
780 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  49.79 
 
 
597 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.91 
 
 
673 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.86 
 
 
1190 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.56 
 
 
632 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
360 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 
603 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  50.4 
 
 
624 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.83 
 
 
1256 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.06 
 
 
716 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
590 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 
738 aa  207  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
490 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
542 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
870 aa  207  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.35 
 
 
687 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  48.19 
 
 
709 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
508 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  49 
 
 
572 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.65 
 
 
761 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.05 
 
 
1194 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.93 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
837 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
870 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 
754 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4894  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
558 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.29 
 
 
664 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>