18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0514 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  54.74 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  33.08 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  32.81 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  31.93 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  32.81 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  29.66 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  30.08 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  26.98 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  31.3 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0273  hypothetical protein  33.87 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  30.65 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  25.64 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  28.78 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  26.23 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>