More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0475 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  100 
 
 
713 aa  1417    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  66.35 
 
 
799 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  38.92 
 
 
435 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  29.11 
 
 
604 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  29.11 
 
 
604 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  28.61 
 
 
607 aa  135  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  33.25 
 
 
656 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  32 
 
 
641 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.02 
 
 
603 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.02 
 
 
603 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  32.08 
 
 
408 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  31.92 
 
 
383 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.97 
 
 
671 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  36.41 
 
 
380 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  38.6 
 
 
632 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  30.23 
 
 
793 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  27.72 
 
 
602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  31.36 
 
 
685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.94 
 
 
710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.94 
 
 
710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.72 
 
 
671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  30.02 
 
 
977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  31.14 
 
 
382 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.94 
 
 
637 aa  114  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.75 
 
 
360 aa  114  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  29.68 
 
 
402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  31.17 
 
 
671 aa  112  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  30.28 
 
 
383 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.31 
 
 
718 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  30.23 
 
 
382 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  32.32 
 
 
383 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  30.85 
 
 
635 aa  108  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.97 
 
 
690 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  29.73 
 
 
402 aa  107  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  27.83 
 
 
711 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  25.9 
 
 
605 aa  106  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  29.22 
 
 
716 aa  106  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  32.06 
 
 
383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  25.78 
 
 
777 aa  106  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  32.06 
 
 
383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.54 
 
 
656 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  29.85 
 
 
339 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.2 
 
 
662 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  29.49 
 
 
667 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25 
 
 
660 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.82 
 
 
684 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.7 
 
 
642 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  37 
 
 
682 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.24 
 
 
695 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  36.15 
 
 
625 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.06 
 
 
660 aa  98.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  24.31 
 
 
603 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  38.99 
 
 
406 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  43.87 
 
 
681 aa  97.4  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  34.01 
 
 
645 aa  97.1  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  43.87 
 
 
681 aa  97.4  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.6 
 
 
634 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.39 
 
 
660 aa  97.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  28.01 
 
 
654 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  43.87 
 
 
680 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.08 
 
 
645 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.52 
 
 
660 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  26.02 
 
 
604 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  39.1 
 
 
362 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  29.87 
 
 
679 aa  96.3  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  34.72 
 
 
695 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.97 
 
 
683 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  40 
 
 
378 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  35.17 
 
 
405 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  29.49 
 
 
358 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.97 
 
 
656 aa  94.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.39 
 
 
716 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  28.43 
 
 
660 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  28.54 
 
 
645 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.95 
 
 
629 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.69 
 
 
647 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.41 
 
 
675 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  29.97 
 
 
685 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.79 
 
 
632 aa  92.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  36.14 
 
 
367 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.2 
 
 
675 aa  92  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.97 
 
 
695 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0716  putative acyltransferase  28.53 
 
 
606 aa  91.3  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  29.74 
 
 
546 aa  90.5  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  29.05 
 
 
658 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  29.2 
 
 
651 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.17 
 
 
679 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  34.29 
 
 
386 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  33.33 
 
 
372 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  29.7 
 
 
428 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  27.41 
 
 
665 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  25.82 
 
 
690 aa  88.2  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.87 
 
 
657 aa  87.8  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  35.88 
 
 
681 aa  87.8  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  27.2 
 
 
635 aa  87.8  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  40 
 
 
675 aa  87.8  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  31.3 
 
 
719 aa  87.4  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.55 
 
 
688 aa  87.4  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  29.12 
 
 
630 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  34.29 
 
 
350 aa  87  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>