More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0449 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  86.64 
 
 
277 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  77.54 
 
 
281 aa  447  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  74.01 
 
 
287 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  73.91 
 
 
279 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  73.65 
 
 
277 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  74.28 
 
 
279 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  72.2 
 
 
277 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  72.2 
 
 
277 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  72.2 
 
 
277 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  73.55 
 
 
279 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  74.37 
 
 
279 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  72.46 
 
 
301 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  71.01 
 
 
277 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  71.01 
 
 
281 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  70.29 
 
 
282 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  71.01 
 
 
279 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  71.12 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  69.93 
 
 
282 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  70.65 
 
 
279 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  73.55 
 
 
279 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  68.59 
 
 
277 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  68.59 
 
 
277 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  68.84 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  69.68 
 
 
275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  67.27 
 
 
275 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  57.72 
 
 
288 aa  337  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  57.82 
 
 
281 aa  325  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  57.45 
 
 
281 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  56.16 
 
 
280 aa  318  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  55.64 
 
 
283 aa  310  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  53.09 
 
 
286 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  51.99 
 
 
286 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 
296 aa  298  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  52.36 
 
 
289 aa  296  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  51.79 
 
 
285 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  54.71 
 
 
297 aa  293  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  55.23 
 
 
297 aa  292  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  54.71 
 
 
285 aa  290  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  50.55 
 
 
281 aa  288  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  51.28 
 
 
305 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 
297 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  51.64 
 
 
306 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  51.46 
 
 
301 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  51.47 
 
 
298 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  51.47 
 
 
298 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  51.47 
 
 
298 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  52.35 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  51.47 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  54.44 
 
 
303 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  50 
 
 
305 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  48.89 
 
 
308 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  50.74 
 
 
312 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  51.43 
 
 
293 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  51.43 
 
 
293 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  48.55 
 
 
291 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  51.81 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  52.48 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
321 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  50.54 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  49.82 
 
 
304 aa  270  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  52.75 
 
 
297 aa  268  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 
297 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  48.75 
 
 
304 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  47.4 
 
 
293 aa  259  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  45.36 
 
 
295 aa  254  9e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  48.41 
 
 
285 aa  253  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
290 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  46.85 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  47.89 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
273 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
366 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 
283 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  34.56 
 
 
277 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  34.16 
 
 
282 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.98 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.19 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.17 
 
 
285 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  35.44 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
314 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  31.94 
 
 
258 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.74 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  32.59 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.7 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.6 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.9 
 
 
289 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.41 
 
 
284 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 
321 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 
321 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.4 
 
 
283 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.53 
 
 
290 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  29.66 
 
 
477 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.06 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.04 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  30.71 
 
 
283 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 
287 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>