More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0435 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  47.55 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.99 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 188 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.44 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  22.77 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  36.7 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  34.04 
 
 		 324 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 303 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  37.27 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  35.71 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>