More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0412 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  39.99 
 
 
1477 aa  811    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.13 
 
 
1502 aa  915    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
1604 aa  3093    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0693  cell division FtsK/SpoIIIE  40.38 
 
 
1615 aa  841    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  39.62 
 
 
1528 aa  885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  35.59 
 
 
1484 aa  700    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.84 
 
 
1446 aa  850    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.1 
 
 
1463 aa  877    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.85 
 
 
895 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.672638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  30 
 
 
1481 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  28.66 
 
 
1493 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.78 
 
 
1488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  30.04 
 
 
1488 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  32.02 
 
 
1468 aa  432  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0638  FHA domain-containing protein  27.05 
 
 
1559 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.449825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  32.19 
 
 
1447 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.22959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6294  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.27 
 
 
844 aa  406  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  32.75 
 
 
1456 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  33.59 
 
 
1399 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2025  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.05 
 
 
1336 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.436887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1985  FtsK/SpoIIIE family protein  25.55 
 
 
1342 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0805  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.68 
 
 
1467 aa  365  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890485  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2209  FtsK/SpoIIIE family protein  27.67 
 
 
1335 aa  357  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.32787e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2035  FtsK/SpoIIIE family protein  27.59 
 
 
1342 aa  353  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2190  FtsK/SpoIIIE family protein  27.59 
 
 
1342 aa  353  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1577  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.81 
 
 
1501 aa  343  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.887078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.15 
 
 
1346 aa  337  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0278  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.41 
 
 
1479 aa  336  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.50338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0271  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.41 
 
 
1479 aa  336  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1033  FtsK/SpoIIIE family protein  26.4 
 
 
1309 aa  332  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.46 
 
 
1478 aa  330  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2089  ftsk/spoiiie family protein  25.54 
 
 
1503 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3216  ftsk/spoiiie family protein  25.54 
 
 
1501 aa  314  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.616613  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1917  FtsK/SpoIIIE family protein  25.56 
 
 
1503 aa  312  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.054291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.83 
 
 
2947 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0407  cell division FtsK/SpoIIIE  28.26 
 
 
1316 aa  294  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  29.08 
 
 
1360 aa  292  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6571  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.47 
 
 
1333 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.2 
 
 
1333 aa  287  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.97 
 
 
1278 aa  286  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.34 
 
 
1249 aa  283  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  27.46 
 
 
1303 aa  280  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.85 
 
 
1349 aa  275  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3495  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.89 
 
 
1555 aa  273  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733864  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04380  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  26.34 
 
 
1334 aa  270  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.765844  normal  0.632338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.55 
 
 
1315 aa  269  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.32 
 
 
1579 aa  262  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0607  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.81 
 
 
1315 aa  261  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4810  cell division FtsK/SpoIIIE  28.95 
 
 
1316 aa  261  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
1318 aa  258  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.52 
 
 
1312 aa  258  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  26.53 
 
 
1335 aa  256  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0991  cell division FtsK/SpoIIIE  26.29 
 
 
1340 aa  254  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.29 
 
 
1229 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  26.33 
 
 
1327 aa  252  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.22 
 
 
1229 aa  252  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.22 
 
 
1229 aa  251  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1683  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.54 
 
 
1359 aa  242  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  29.73 
 
 
1346 aa  240  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4625  cell division protein FtsK/SpoIIIE  26.5 
 
 
1332 aa  239  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18785  normal  0.38778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2491  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.98 
 
 
1313 aa  238  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717331  normal  0.28838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1210  cell division protein FtsK/SpoIIIE  28.18 
 
 
1320 aa  235  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.978992  normal  0.356707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0303  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.25 
 
 
1326 aa  229  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.48 
 
 
1348 aa  227  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0865  cell division FtsK/SpoIIIE  27.41 
 
 
1335 aa  226  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.351933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3214  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.98 
 
 
1330 aa  223  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.248908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2826  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.32 
 
 
1065 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.1 
 
 
1438 aa  214  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0694  cell division FtsK/SpoIIIE  25.37 
 
 
1336 aa  210  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.809205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1402  FHA domain containing protein  30.17 
 
 
946 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  40.69 
 
 
1363 aa  193  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4959  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.74 
 
 
1183 aa  189  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156858  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  42.92 
 
 
607 aa  184  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  46.29 
 
 
608 aa  183  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.26 
 
 
1336 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.52 
 
 
1320 aa  178  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786976  decreased coverage  0.000163862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2394  cell division FtsK/SpoIIIE  52.14 
 
 
1317 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206557  hitchhiker  0.00430147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07490  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  42.92 
 
 
999 aa  164  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1968  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.35 
 
 
1066 aa  161  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5461  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.49 
 
 
1380 aa  159  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4137  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5772  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.71 
 
 
1386 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789275  normal  0.647341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.6 
 
 
745 aa  151  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0075  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.6 
 
 
745 aa  151  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0751405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.6 
 
 
745 aa  151  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.627521  hitchhiker  0.00968716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13905  transmembrane protein  37.65 
 
 
747 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0074  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.88 
 
 
740 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.669354  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0771  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.33 
 
 
742 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  34.6 
 
 
1236 aa  147  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10291  hypothetical protein  27.65 
 
 
1330 aa  145  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0439704  normal  0.4353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13929  hypothetical protein  23.36 
 
 
1396 aa  139  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0413  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.07 
 
 
1331 aa  138  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.268259  normal  0.267879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.4 
 
 
1328 aa  138  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0372  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.33 
 
 
1321 aa  136  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0382  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.33 
 
 
1321 aa  136  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612142  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.33 
 
 
1321 aa  136  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563466  normal  0.967672 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5557  cell division FtsK/SpoIIIE  27.05 
 
 
1389 aa  135  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.05 
 
 
1389 aa  135  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11814  hypothetical protein  24.6 
 
 
1391 aa  126  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.284555  normal  0.623298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.79 
 
 
1020 aa  108  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4990  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.04 
 
 
963 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>