16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0404 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  950    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1030  hypothetical protein  76.7 
 
 		 572 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5326  replication initiator protein  76.99 
 
 		 572 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5522  replication initiator protein  76.97 
 
 		 569 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0195674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5539  replication initiator protein  75 
 
 		 573 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6307  replication initiator protein  75.37 
 
 		 572 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0041  hypothetical protein  58.85 
 
 		 552 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8558  replication initiator protein  57.52 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404857  hitchhiker  0.00106122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0922  hypothetical protein  54.8 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5291  hypothetical protein  53.35 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.872454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0150  hypothetical protein  49.89 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0693  hypothetical protein  48.43 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6362  hypothetical protein  50.11 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2945  hypothetical protein  55.36 
 
 		 56 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23890  hypothetical protein  31.2 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0719573  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1563  replication initiation protein  30.51 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>