More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0346 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  947    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  52.44 
 
 		 441 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  47 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  51.38 
 
 		 452 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  50.12 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  46.79 
 
 		 438 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  48.53 
 
 		 447 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  46.94 
 
 		 437 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  46.9 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  45.43 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  45.27 
 
 		 433 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  44.58 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  45.71 
 
 		 432 aa  339  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  44.49 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  44.08 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.43 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  45.03 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  43.48 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  40.73 
 
 		 445 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  41.63 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  39.63 
 
 		 428 aa  296  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  32.87 
 
 		 437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  33.41 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  33.41 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  32.72 
 
 		 437 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  32.95 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  32.95 
 
 		 437 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  32.72 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  32.72 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  36.99 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.55 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  34.09 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  35.31 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  34.47 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.19 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  34.43 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  32.65 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  32.87 
 
 		 417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  30.43 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  28.41 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  30.96 
 
 		 415 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  27.83 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  29.07 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  29.13 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  28.9 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  29.14 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.89 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  31.52 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  31.46 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.02 
 
 		 427 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.14 
 
 		 462 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  34.28 
 
 		 246 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  24.8 
 
 		 556 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.25 
 
 		 574 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.09 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  24.24 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.34 
 
 		 572 aa  100  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25.84 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.05 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  21.88 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  21.88 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.58 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  25 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.04 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.41 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.95 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.72 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.01 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 		 539 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  33.06 
 
 		 761 aa  66.6  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.01 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  28.16 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.11 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  26.84 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  22.22 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  22.22 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  32.73 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  30.6 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>