184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0263 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  86.6 
 
 		 194 aa  345  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  67.86 
 
 		 191 aa  269  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  67.35 
 
 		 191 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  67.35 
 
 		 222 aa  261  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  66.33 
 
 		 191 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  66.33 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  66.84 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  64.29 
 
 		 191 aa  249  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  63.78 
 
 		 192 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  61.22 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  59.69 
 
 		 192 aa  230  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  59.69 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  59.18 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  58.16 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  57.44 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  57.44 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  57.44 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  56.12 
 
 		 192 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  56.63 
 
 		 191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  55.61 
 
 		 192 aa  217  8.999999999999998e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  56.12 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  56.63 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  56.12 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  56.12 
 
 		 191 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  56.57 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  52.55 
 
 		 192 aa  214  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  56.12 
 
 		 191 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  55.15 
 
 		 191 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  57.14 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  57.14 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  55.33 
 
 		 192 aa  207  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  54.08 
 
 		 191 aa  207  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  55.1 
 
 		 192 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  55.61 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  55.61 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  54.82 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  58.46 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  53.57 
 
 		 248 aa  204  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  54.59 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  54.08 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  54.59 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  57.95 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  53.06 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  50.51 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  52.04 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  53.57 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  50.51 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  52.06 
 
 		 190 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  52.31 
 
 		 191 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  48.47 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  48.47 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  47.96 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  47.96 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  47.96 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  47.96 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  47.54 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  47.45 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  47.45 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  48.97 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  46.99 
 
 		 190 aa  177  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  45.92 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  46.94 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  45.9 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  50 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  50 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  50 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 196 aa  170  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  49.47 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  46.84 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  46.94 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  45.92 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  46.32 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  44.21 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  44.21 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  42.35 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  44.92 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  46.28 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  44.56 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  45.08 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  45.96 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  45.96 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  44.04 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  42.71 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  43.68 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  43.16 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  44.04 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  42.63 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  44.04 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  43.52 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  41.03 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>