37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0258 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  100 
 
 		 272 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  77.78 
 
 		 286 aa  348  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  56.11 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  54.9 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  53.94 
 
 		 256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  53.52 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  50.62 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  51.24 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  52.21 
 
 		 437 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  48.36 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  50.42 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  48.76 
 
 		 241 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  45.97 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  44.98 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  42.91 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  45.45 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  44.88 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  47.11 
 
 		 269 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  48.78 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  46.92 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  43.53 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  43.51 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  41.64 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  45.12 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  50.66 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  43.49 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  43.49 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  44.03 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  44.72 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  44.72 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  45.31 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  40.4 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  42.15 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  35.92 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.41 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  32.61 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>