More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0231 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
448 aa  877    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  74.73 
 
 
481 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50.23 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.7 
 
 
453 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  44.23 
 
 
450 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  45.54 
 
 
447 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.41 
 
 
469 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  39.5 
 
 
496 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
481 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  30.68 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.37 
 
 
447 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  29.44 
 
 
445 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.23 
 
 
445 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.51 
 
 
419 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32 
 
 
444 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.27 
 
 
465 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  32.61 
 
 
442 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.57 
 
 
444 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.22 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  31.23 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  27.91 
 
 
443 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.91 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.39 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  28.86 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.73 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.34 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  25.36 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.21 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.04 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  31.03 
 
 
355 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.79 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.75 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  26.83 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.49 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  29.54 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.24 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.03 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.45 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  29.49 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  27.23 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.49 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  29.18 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.18 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.87 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.21 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  29.18 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  32.69 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.03 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.75 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.03 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.01 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.18 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.76 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  26.67 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.76 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.76 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.76 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  30.04 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.13 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.2 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.49 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.33 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.48 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.61 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  34.11 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  26.89 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  26.89 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  29.03 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.85 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.51 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.88 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  28.19 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  24.27 
 
 
248 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.7 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.91 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  28.51 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  24.23 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.62 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.23 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.43 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  24.27 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.42 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.52 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.88 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.96 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.12 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  23.73 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  28.62 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.69 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  31.88 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  27 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  27.04 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  24.68 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.43 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  20.73 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>