216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0115 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0115  transposase, IS4  100 
 
 		 331 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0392  transposase, IS4  48.84 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1119  transposase, IS4  48.84 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2121  transposase, IS4  48.84 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0994  transposase, IS4 family protein  45.35 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1595  transposase IS4 family protein  37.98 
 
 		 483 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3126  hypothetical protein  73.64 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4120  transposase, IS4  35.34 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0300  transposase, IS4  36.86 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.563968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0672  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1108  transposase, IS4  39.34 
 
 		 404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280026  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1189  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.944159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1776  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1962  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2052  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460189  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2330  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2481  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650246  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2704  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2799  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2941  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3313  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4115  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4218  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.378092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4220  transposase, IS4  36.86 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  37.1 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  37.1 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  37.1 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3990  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0122  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2708  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2712  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4067  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4155  transposase, IS4  40.39 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.915026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1950  transposase, IS4  32.85 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2467  transposase, IS4  32.85 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2773  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  33.09 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  33.09 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  33.09 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  34.31 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5320  hypothetical protein  32.43 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  27.82 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  27.38 
 
 		 248 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  27.38 
 
 		 248 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  27.52 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0078  hypothetical protein  47.33 
 
 		 222 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  26.74 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  28.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  28.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  28.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  28.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  28.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  26.61 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  24.22 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  23.83 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  23.83 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5311  putative transposase  29.7 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  24.22 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  25.78 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  23.83 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>