16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0098 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0098  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  544  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7206  hypothetical protein  86.59 
 
 
276 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0160  hypothetical protein  41.94 
 
 
329 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261624  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8996  hypothetical protein  41.4 
 
 
285 aa  174  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0169  hypothetical protein  41.94 
 
 
279 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3347  hypothetical protein  38.21 
 
 
291 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.444208  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4390  hypothetical protein  38.08 
 
 
291 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0300  hypothetical protein  34.36 
 
 
311 aa  136  3e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2750  hypothetical protein  30.46 
 
 
347 aa  130  2e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0295  hypothetical protein  41.77 
 
 
337 aa  115  9e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5980  hypothetical protein  36.79 
 
 
304 aa  114  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37780  hypothetical protein  31.6 
 
 
302 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.245305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6841  hypothetical protein  32.88 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0628  hypothetical protein  27.84 
 
 
297 aa  78.6  1e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01940  hypothetical protein  32.3 
 
 
300 aa  77.8  2e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0418  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  72.8  6e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>