39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0096 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0096  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7208  hypothetical protein  85.29 
 
 
68 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.073484  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0167  hypothetical protein  63.83 
 
 
71 aa  60.1  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459821  hitchhiker  0.00010611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0297  hypothetical protein  63.27 
 
 
71 aa  58.9  2e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0158  hypothetical protein  61.7 
 
 
71 aa  58.2  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843726  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3574  hypothetical protein  75 
 
 
66 aa  57.8  5e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.021517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4920  hypothetical protein  52.31 
 
 
59 aa  57.8  5e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4537  hypothetical protein  52.31 
 
 
59 aa  57.8  5e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4624  hypothetical protein  52.31 
 
 
59 aa  57.8  5e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5110  hypothetical protein  50.77 
 
 
61 aa  57  8e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122745  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18640  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  56.6  1e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00906092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1637  hypothetical protein  47.69 
 
 
62 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3552  hypothetical protein  72.22 
 
 
55 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00116548  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2749  hypothetical protein  57.69 
 
 
79 aa  55.8  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0897128  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2350  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  55.1  3e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10825  hypothetical protein  70 
 
 
60 aa  55.1  4e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.149368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37790  hypothetical protein  57.78 
 
 
61 aa  54.7  4e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8994  hypothetical protein  56.45 
 
 
77 aa  54.7  5e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542043  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3345  hypothetical protein  63.64 
 
 
75 aa  54.3  5e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  0.696912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06070  hypothetical protein  72.5 
 
 
64 aa  54.3  6e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6013  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4389  hypothetical protein  50.79 
 
 
75 aa  53.9  7e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4756  hypothetical protein  72.97 
 
 
73 aa  53.1  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0950  hypothetical protein  69.7 
 
 
58 aa  51.2  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3087  hypothetical protein  52.31 
 
 
66 aa  50.8  6e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6842  hypothetical protein  72.73 
 
 
60 aa  49.7  1e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5041  hypothetical protein  44.93 
 
 
80 aa  49.7  1e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34070  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  48.5  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.254911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08980  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  47.4  6e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4039  hypothetical protein  69.7 
 
 
85 aa  47  8e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.689031  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5982  hypothetical protein  66.67 
 
 
71 aa  47  9e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3514  hypothetical protein  60.53 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2070  hypothetical protein  51.16 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3477  hypothetical protein  46.67 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0021  hypothetical protein  39.68 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.206071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2906  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0430043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0298  hypothetical protein  63.64 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4314  hypothetical protein  63.64 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1392  hypothetical protein  46.97 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.343231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3738  hypothetical protein  45 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>