More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0094 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  68.34 
 
 
517 aa  647  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  69.98 
 
 
484 aa  665  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  69.3 
 
 
512 aa  658  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  70.94 
 
 
525 aa  664  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  69.56 
 
 
478 aa  659  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  68.83 
 
 
526 aa  653  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  67.16 
 
 
515 aa  634  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  64.74 
 
 
511 aa  641  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  66.81 
 
 
513 aa  642  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  67.79 
 
 
515 aa  650  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  65.76 
 
 
514 aa  636  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  68.91 
 
 
534 aa  659  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
544 aa  1090  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
511 aa  635  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
511 aa  635  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  63.48 
 
 
510 aa  643  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  67.56 
 
 
498 aa  641  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  61.45 
 
 
563 aa  635  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
511 aa  635  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  69.49 
 
 
526 aa  658  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  69.96 
 
 
500 aa  655  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  68.01 
 
 
502 aa  644  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  87.2 
 
 
623 aa  875  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  67.44 
 
 
505 aa  661  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  67.57 
 
 
515 aa  642  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  69.67 
 
 
512 aa  665  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
517 aa  643  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  68.58 
 
 
519 aa  657  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  65.57 
 
 
514 aa  636  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  63.74 
 
 
527 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  66.32 
 
 
525 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  59.93 
 
 
558 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  64.83 
 
 
506 aa  615  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  64.16 
 
 
496 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  60.97 
 
 
518 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  59.46 
 
 
537 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  52.99 
 
 
493 aa  494  1e-138  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  54.25 
 
 
466 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
466 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
488 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
493 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
499 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
488 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
503 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
468 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
500 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
492 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
494 aa  471  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
494 aa  471  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
478 aa  471  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
496 aa  466  1e-130  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
469 aa  468  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
474 aa  468  1e-130  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
465 aa  466  1e-130  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
501 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
467 aa  460  1e-128  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
488 aa  460  1e-128  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
482 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
496 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  52.79 
 
 
485 aa  452  1e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
466 aa  454  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.79 
 
 
485 aa  452  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
482 aa  452  1e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.43 
 
 
485 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
477 aa  452  1e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
470 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
468 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
477 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  48.2 
 
 
470 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
471 aa  447  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
474 aa  446  1e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  447  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  446  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
471 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
471 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
472 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  47 
 
 
472 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
482 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
487 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
471 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  48.13 
 
 
474 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
472 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
497 aa  442  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
475 aa  442  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
472 aa  441  1e-122  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
484 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1942  amidophosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
478 aa  435  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
465 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  44.92 
 
 
474 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  46.97 
 
 
475 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
475 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
472 aa  432  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
473 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
480 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
451 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>