46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0093 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  517  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  51.93 
 
 
336 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  40.86 
 
 
255 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  60.58 
 
 
151 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  59.29 
 
 
146 aa  119  5e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  58.95 
 
 
126 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  59.6 
 
 
117 aa  114  2e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  61.7 
 
 
126 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  56.36 
 
 
125 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  50.81 
 
 
166 aa  111  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  57.45 
 
 
158 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  57.61 
 
 
115 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  50.91 
 
 
169 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  58.42 
 
 
138 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  52.78 
 
 
198 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  56.52 
 
 
129 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  61.11 
 
 
125 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  56.7 
 
 
119 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  55.45 
 
 
130 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  58.14 
 
 
137 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  52.13 
 
 
125 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  56.52 
 
 
125 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  57.61 
 
 
140 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  55.43 
 
 
128 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  56.52 
 
 
123 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  53.76 
 
 
138 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  52.87 
 
 
133 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  50.52 
 
 
133 aa  89.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  51.04 
 
 
149 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  42.5 
 
 
129 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  53.75 
 
 
126 aa  80.5  2e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  42.62 
 
 
129 aa  80.1  3e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  34.68 
 
 
138 aa  72  1e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  41.18 
 
 
139 aa  67.4  2e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  29.1 
 
 
237 aa  65.1  1e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32190  hypothetical protein  35.12 
 
 
243 aa  50.4  3e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.648971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3118  hypothetical protein  32.5 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2113  hypothetical protein  29.45 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2918  hypothetical protein  34.34 
 
 
233 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3105  hypothetical protein  31.21 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  30.38 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0608  hypothetical protein  33.11 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  29.75 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>