More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0086 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  273  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  76.26 
 
 
141 aa  195  2e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 
162 aa  133  1e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 
148 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  52.82 
 
 
144 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  51.82 
 
 
158 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  51.43 
 
 
144 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  54.01 
 
 
156 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  57.78 
 
 
153 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
149 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
147 aa  119  2e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  54.93 
 
 
151 aa  119  2e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
144 aa  119  2e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 
143 aa  119  2e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
139 aa  115  2e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  113  8e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  113  8e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
143 aa  113  8e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
151 aa  112  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
143 aa  109  1e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  47.45 
 
 
146 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  51.16 
 
 
161 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
163 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 
152 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  47.58 
 
 
150 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 
157 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
156 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
151 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  43.75 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
139 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
162 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
149 aa  82.8  1e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
150 aa  82.4  2e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
159 aa  81.6  3e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
156 aa  81.3  4e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
150 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 
150 aa  79.7  1e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
156 aa  79  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
162 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
162 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
162 aa  78.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
159 aa  78.6  3e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.64 
 
 
163 aa  77  7e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
150 aa  75.1  3e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 
142 aa  74.7  4e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
161 aa  74.3  6e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
146 aa  73.2  1e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.98 
 
 
157 aa  72.8  2e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
163 aa  72.4  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
150 aa  69.3  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
150 aa  68.9  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
159 aa  68.9  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
157 aa  67.8  4e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 
147 aa  67.8  5e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
146 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
151 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
144 aa  67.4  6e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
146 aa  67  8e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
161 aa  67  9e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
153 aa  66.6  1e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  36.51 
 
 
149 aa  64.7  4e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
146 aa  64.7  4e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  64.7  5e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  41.74 
 
 
150 aa  64.3  6e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 
175 aa  63.5  9e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 
147 aa  63.2  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  62  2e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
152 aa  61.6  4e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 
157 aa  61.2  5e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
171 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
171 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
152 aa  58.9  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.49259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.56 
 
 
159 aa  59.3  2e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
168 aa  58.9  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
177 aa  58.5  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57.8  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 
150 aa  57  8e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
150 aa  57  8e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
173 aa  57  8e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.59 
 
 
157 aa  57  9e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
161 aa  57  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  34.74 
 
 
173 aa  56.2  1e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.81 
 
 
138 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>