More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0082 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
374 aa  752  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  86.9 
 
 
374 aa  668  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  72.63 
 
 
373 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  71.82 
 
 
370 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  70.4 
 
 
375 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  69.6 
 
 
373 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  68.98 
 
 
377 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  70.67 
 
 
369 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  69.07 
 
 
376 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  69.15 
 
 
377 aa  517  1e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  68.27 
 
 
370 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  69.65 
 
 
376 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  66.93 
 
 
375 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  66.58 
 
 
381 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  65.87 
 
 
417 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  64 
 
 
376 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  66.4 
 
 
375 aa  484  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  63.4 
 
 
376 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 
370 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  64.05 
 
 
376 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  63.14 
 
 
374 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  65.4 
 
 
371 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  63.71 
 
 
395 aa  468  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 
374 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  66.13 
 
 
372 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  63.98 
 
 
378 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 
370 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 
370 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 
370 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  60.98 
 
 
387 aa  445  1e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  65.04 
 
 
385 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 
372 aa  439  1e-122  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 
379 aa  435  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  60.64 
 
 
393 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  55.59 
 
 
380 aa  405  1e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  56.27 
 
 
382 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  59.73 
 
 
369 aa  401  1e-110  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  58.62 
 
 
378 aa  399  1e-110  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  43.9 
 
 
373 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.91 
 
 
383 aa  144  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.09089e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  28.81 
 
 
357 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  28.72 
 
 
410 aa  111  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  29.1 
 
 
385 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.77 
 
 
338 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  27.27 
 
 
352 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  25.92 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  28.27 
 
 
390 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  28.91 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  27.59 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.59 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.33 
 
 
363 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  28.79 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  27.78 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  27.08 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  24.66 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.49 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  26.89 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  28.34 
 
 
385 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  28.61 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  28.34 
 
 
385 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  28.27 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  24.66 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  28.09 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  27.55 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.52 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  26.32 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.81 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.95852e-15  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  25.49 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  25.96 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.1 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.55 
 
 
360 aa  85.9  1e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  28.12 
 
 
389 aa  85.9  1e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  27.44 
 
 
390 aa  84  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 
391 aa  83.6  6e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  28.21 
 
 
361 aa  83.2  7e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  24.66 
 
 
355 aa  83.2  7e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.54514e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  27.42 
 
 
390 aa  82.8  9e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.1 
 
 
375 aa  82.8  9e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 
391 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 
390 aa  82  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 
391 aa  82  1e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  26.54 
 
 
358 aa  82.4  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 
359 aa  82.4  1e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  23.48 
 
 
358 aa  82.8  1e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  28.46 
 
 
384 aa  81.6  2e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  23.48 
 
 
358 aa  81.6  2e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  25.19 
 
 
381 aa  80.9  3e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  24.93 
 
 
357 aa  81.3  3e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  26.25 
 
 
391 aa  80.5  4e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  25.62 
 
 
362 aa  80.9  4e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  25.34 
 
 
392 aa  80.1  6e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  26.58 
 
 
370 aa  79.7  7e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0271  phosphoserine aminotransferase  24.68 
 
 
384 aa  79  1e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  25.82 
 
 
360 aa  79.3  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  27.93 
 
 
381 aa  79  1e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>