More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0076 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
231 aa  469  1e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.84 
 
 
295 aa  352  3e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.41 
 
 
277 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.29 
 
 
249 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8763  hypothetical protein  43.5 
 
 
303 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4333  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.55 
 
 
274 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.03 
 
 
132 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0509  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.61 
 
 
287 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.74 
 
 
212 aa  110  2e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36030  Ykud domain-containing protein  37.74 
 
 
254 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8227  hypothetical protein  36.08 
 
 
261 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.47 
 
 
303 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5686  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
273 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4259  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.91 
 
 
233 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098487  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.8 
 
 
112 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2688  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
292 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00428161  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4659  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.94 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0138559  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
199 aa  82  6e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421702  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
238 aa  78.2  9e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 
217 aa  75.1  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.97 
 
 
193 aa  74.7  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644792  decreased coverage  0.00106485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.03 
 
 
283 aa  74.3  1e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35 
 
 
289 aa  72.8  4e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.16 
 
 
165 aa  72.4  5e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
181 aa  71.2  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.34 
 
 
165 aa  71.2  1e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.11 
 
 
156 aa  70.5  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.59 
 
 
217 aa  69.3  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.39 
 
 
382 aa  67.8  1e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.59 
 
 
192 aa  67.4  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  66.2  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  66.2  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  66.2  4e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  66.2  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  66.2  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  65.5  6e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  65.5  6e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.69 
 
 
382 aa  65.5  7e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.53435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.43 
 
 
167 aa  65.1  8e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.31193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.08 
 
 
194 aa  65.1  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.08 
 
 
194 aa  65.1  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.06 
 
 
307 aa  64.7  1e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.14 
 
 
263 aa  63.9  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
463 aa  63.9  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  34.62 
 
 
180 aa  63.5  3e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
186 aa  62.8  4e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  4e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  4e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  4e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  29.23 
 
 
186 aa  62.4  5e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  29.23 
 
 
186 aa  62.4  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.48074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  62.8  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.41 
 
 
415 aa  62.4  6e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  62.4  6e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  29.23 
 
 
186 aa  62.4  6e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2845  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
169 aa  62  7e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.09 
 
 
490 aa  62  8e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
292 aa  62  8e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.8 
 
 
255 aa  62  8e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  31.25 
 
 
153 aa  62  8e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.93 
 
 
389 aa  61.6  9e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.63 
 
 
332 aa  61.6  9e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
153 aa  61.6  9e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.24 
 
 
411 aa  61.2  1e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.51939e-07 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2943  hypothetical protein  30.34 
 
 
423 aa  61.6  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2629  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.72 
 
 
463 aa  61.6  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279699  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.03 
 
 
307 aa  60.5  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.92 
 
 
223 aa  60.5  2e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.83 
 
 
206 aa  60.8  2e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 
294 aa  60.1  3e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.33 
 
 
216 aa  60.1  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.75 
 
 
168 aa  60.1  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2889  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
466 aa  59.3  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  33.79 
 
 
285 aa  59.7  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.51 
 
 
294 aa  59.7  4e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.79 
 
 
285 aa  59.7  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02338  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.59 
 
 
271 aa  59.3  5e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
315 aa  59.3  5e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.89 
 
 
230 aa  59.3  5e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.50825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.9 
 
 
300 aa  59.3  5e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.36 
 
 
205 aa  58.9  6e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1586  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.79 
 
 
284 aa  58.5  7e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.4 
 
 
318 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  4.97106e-11  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 
204 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 
337 aa  58.2  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1506  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.6 
 
 
334 aa  58.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.035411  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0522  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.14 
 
 
192 aa  57.8  1e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1255  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.28 
 
 
329 aa  57.8  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0180405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1402  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.6 
 
 
332 aa  57.4  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742289  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  57.4  2e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.66 
 
 
284 aa  57  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.514235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.09 
 
 
339 aa  57.4  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3010  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.06 
 
 
318 aa  57.4  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.79964  hitchhiker  0.00810572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4890  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.35 
 
 
327 aa  57  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  56.6  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 
344 aa  56.6  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>